از اهداف دیگر این مرکز هدف نشر علم و معرفت و اصلاح نظریات و دیدگاه های دینی با بهره گیری از منابع اصیل اسلامی مانند قرآن کریم و سنت شریف است و در این راه از تجربه دینی حوزه علمیه نجف اشرف و تلاش طلاب علوم دینی و اساتید دانشگاه نیز استفاده می کند و درهای این مرکز به روی تمام محققان گشوده است.
این مرکز در حال حاضر پنج بخش دارد که عبارتند از: بخش پژوهش های قرآنی؛ بخش پژوهش های اعتقادی و فکری؛ بخش پژوهش های تخصصی امام مهدی علیه السلام؛ بخش فقه اسلامی و بخش فقه اجتماعی و بخش های دیگر این مرکز در زمینه پژوهش های اقتصاد اسلامی و تاریخ و علوم حدیث و زبان عربی به زودی افتتاح خواهد شد.