به گزارش پایگاه اطلاع رسانی محراب، مسجد حَنّانه، در بین راه نجف و کوفه، سمت شمال نجف، واقع است. بر طبق نقلهای تاریخی و به اعتقاد شیعیان، زمین این مسجد دو بار در عزای امامان شیعه، یک بار در زمان تشییع علی بن ابی‌طالب(ع) و یک بار نیز بعد از واقعه عاشورا ناله کرده است.
در این محل ستون (یا دیواری) قرار داشته است که هنگام تشییع شبانه علی از کوفه به نجف وقتی بدن وی را از کنار این مکان عبور می‌دادند، این ستون از حزن و تأسف خم شد که بر اساس نظر شیخ طوسی ظاهراً مسجد حنّانه، در جایگاه همان ستون بنا شده است. در روایتی از جعفر صادق آمده است «هنگامی که جنازه علی را از اینجا عبور می دادند این ستون از اندوه بر درگذشت او خم شد، چنانکه تخت ابرهه هنگام ورود عبدالمطلب بر او خم شد».
همچنین شیعیان معتقدند، به هنگام حمل سرهای کشتگان کربلا به کوفه، سر حسین را بر زمین این مسجد گذاشتند. گفته‌اند در این هنگام صدایی شبیه به ناله بچه شتری (حنانه) که مادرش را گم کرده باشد بلند شد. نقل شده است که جعفر صادق هنگام سفر به کوفه و نجف، در سه مکان ایستاده و نماز گزارده است که یکی از آنها در این محل بود: «سر جدم حسین را در اینجا نهادند».
در وجه نامگذاری این مسجد گفته‌اند حنانه (گریه‌کننده) نامیدن این مسجد به علت ناله آن ستون در زمان تشیع جنازه علی است. وجه دیگر را ناله زمین این منطقه در زمان حضور سرهای کشتگان کربلا دانسته‌اند. برخی نیز گفته‌اند نام این مسجد از «حنا»، نام دیر قدیمی مسیحیان که در این محل قرار داشته، گرفته شده است.
