خداوند از این مسجد به لحاظ این که براساس تقوا و اخلاص بنا شده ستایش و تمجید کرده و به حضور و اقامه نماز در آن تشویق و ترغیب نموده است:
«... لَمَسجِدٌ اُسِّسَ عَلَى التَّقوى مِن اَوَّلِ یَومٍ اَحَقُّ اَن تَقومَ فیهِ...».[1]
«آن مسجدى که از روز نخست براساس تقوا بنا شده شایسته تر است در آن به عبادت و نماز قیام کنى».
پیامبر اعظم صلى الله علیه وآله درباره فضیلت حضور و نماز در آن فرموده است:
«مَن تَطَهّرَ فى بَیتِهِ ثُمَّ أتى مسجدَ قُباء فَصلّى فیهِ رکعتین کانَ کأجرِ عُمرَة».[2]
«کسى که در خانهاش وضو بگیرد، آنگاه به مسجد قبا درآید و دو رکعت نماز بگزارد، ثواب یک عمره را برده است».
[1] . سوره توبه، آیه 108 .
[2] . آثار اسلامى مکّه و مدینه، ص 246 .